更新情報10/11(日)

電子カルテの普及率|診療所は55.0%(令和5年)・72.6%(2026年6月)の違いと数え方【2026年】

クリニックツールナビ編集部公開

要点

診療所の電子カルテ普及率は、厚生労働省の医療施設調査(令和5年)では一般診療所の55.0%(57,662/104,894施設)です。より新しい社会保険診療報酬支払基金のアンケート(2026年6月5日〜10日)では、回答した医科診療所の72.6%(51,985施設)が導入済みで、19.3%(13,844施設)が「導入予定なし」と答えています。どちらも厚生労働省の電子カルテ普及計画(2026年9月9日)に載っている数字です。

2つの数字の違い

55.0%と72.6%は、調査の時期・方法・分母が違うため、そのまま比べられません。

項目医療施設調査支払基金アンケート
実施厚生労働省(3年に1度)社会保険診療報酬支払基金(医療情報基盤・診療報酬審査支払機構)が実施し、厚生労働省が集計
時点令和5年2026年6月5日〜10日
対象一般診療所(歯科医業のみの診療所を除く)医科診療所
導入率55.0%(57,662/104,894)72.6%(51,985/71,616)
分母一般診療所の数アンケートで導入状況を答えた医科診療所の数
数字診療所の電子カルテ導入率(電子カルテ普及計画に載っている数字)
  • 55.0%一般診療所医療施設調査・令和5年
  • 72.6%医科診療所支払基金アンケート・2026年6月
  • 19.3%導入予定なし同アンケート・医科診療所

支払基金のアンケートでは、導入状況を答えなかった医科診療所が3,962施設あります。これを未導入に含めて計算すると、導入済みの割合は68.8%になります(普及計画の表の<>の数字)。

医科診療所の導入予定の内訳

支払基金のアンケートで未導入と答えた医科診療所は19,631施設(27.4%)で、そのうち導入の予定は次のとおりです。

回答施設数割合
今年度中に導入1,2361.7%
来年度中に導入8471.2%
再来年度以降に導入3,7045.2%
導入予定なし13,84419.3%

割合は、導入状況を答えた医科診療所71,616施設に対するものです。

医療施設調査で見る推移

医療施設調査では、一般診療所の導入率は平成20年の14.7%から令和5年の55.0%まで上がっています。

年一般診療所一般病院
平成20年14.7%14.2%
平成23年21.2%21.9%
平成26年35.0%34.2%
平成29年41.6%46.7%
令和2年49.9%57.2%
令和5年55.0%65.6%

平成23年は、宮城県の石巻医療圏・気仙沼医療圏と福島県の全域を除いた数値です。

導入していない診療所の理由

日本医師会が紙カルテを使っている診療所に行った調査(2025年4月18日〜6月1日、有効回答5,466件)では、54.2%が「導入不可能」と答えています。普及計画に載っている要約では、導入できない理由として、ITに不慣れ(電子カルテの操作に時間がかかる)、導入費用が高額、導入しても数年しか使う見込みがない、といった回答が多いとされています。「導入不可能」と答える割合は、高齢者ほど高いとされています。

国の目標と、これからの数え方

国は、2030年末(令和12年12月31日)までに電子カルテの普及率を約100%にすることを法律の目標にしています(医療介護総合確保法 第12条の3第4項。条文の中身は 「2030年に普及率約100%」は義務化かを説明した記事)。医療情報化推進方針では、目標を「必要な患者の医療情報の共有が可能な電子カルテの普及率約100%」と書いています。

普及計画の推計は、医科診療所の母数を「オンライン資格確認を導入(運用開始)している医科診療所数」の83,000施設とし、足元の導入施設数を、この母数に支払基金アンケートの導入率を掛けて出しています。アンケートで導入状況を答えなかった施設は、未導入として扱っています。

関係普及計画の推計での足元の導入数の出し方
  1. オン資導入の診療所83,000施設
  2. 掛ける
  3. アンケートの導入率2026年6月
  4. 出す
  5. 足元の導入施設数未回答は未導入扱い

これから導入する診療所向けに、国は認証制度を準備しており、認証製品の導入の補助は令和9年度の概算要求に入っています。認証制度と各製品の対応状況は /ninsho、製品の比較は 電子カルテの比較、開業を準備している医師向けの情報は 開業準備のページ にまとめています。

  1. 1

    MAPs for CLINIC4.5/5

    株式会社EMシステムズ・電子カルテ

    ¥20,000〜/月無料で試せるクラウド電子処方箋整形外科・耳鼻咽喉科・小児科ほか2

    レセコン機能を一体で持つ診療所向けのクラウド電子カルテで、ORCAとの連携も選べる。初期ライセンスは無料の月額制で、Web予約・問診やレセプトチェックの機能を含む。

  2. 2

    Medicom クラウドカルテ4.5/5

    ウィーメックス株式会社・電子カルテ

    ¥24,800〜/月無料で試せるクラウド電子処方箋

    ウィーメックスのクリニック向けクラウド型電子カルテで、レセコン機能を一体で備える。Basicプランは初期費用と月額を公式に示しており、Premiumプランは見積りとなる。

  3. 3

    エムスリーデジカル4.5/5

    エムスリーデジカル株式会社・電子カルテ

    ¥11,800〜/月無料で試せるクラウド電子処方箋

    クラウド型の電子カルテで、レセコン一体型プランとORCA連動型プランから選べる。ブラウザで動作し、電子処方箋に対応している。

  4. 4

    CLIUS(クリアス)4.0/5

    株式会社DONUTS・電子カルテ

    ¥12,000〜/月無料で試せるクラウド電子処方箋小児科・在宅医療

    DONUTSのクリニック向けクラウド型電子カルテで、レセコンにはWEB ORCAを使う。導入作業込みの通常プランと、自分で設定するDirectプランがあり、歯科・鍼灸院・接骨院は対象外。

  5. 5

    CLINICSカルテ3.5/5

    株式会社メドレー・電子カルテ

    料金は問い合わせ無料で試せるクラウド電子処方箋

    自社開発のレセプト機能と一体になった診療所向けのクラウド電子カルテ。Web予約・問診、自動精算機、検査会社などと連携し、iPadでの手書き記録にも対応する。

編集部スコア順(2026年10月11日時点)。当てはまる21本のうち5本を表示。スコアは機能の優劣ではなく、選ぶための公開情報がそろっているかの目安です(採点方法)。

当てはまる21本をすべて見る

よくある質問

診療所の電子カルテ普及率は結局何%ですか

公的な統計の最新値は、医療施設調査(令和5年)の一般診療所55.0%です。より新しい数字として、支払基金のアンケート(2026年6月)では回答した医科診療所の72.6%が導入済みで、未回答の施設を未導入に含めると68.8%です。

次の医療施設調査はいつですか

医療施設調査は3年に1度行われる調査です(普及計画の記載)。令和5年の次の調査の結果の公表時期は、2026年10月時点の資料では確認できていません。

歯科診療所や病院の普及率は

支払基金のアンケート(2026年6月)では、歯科診療所の導入済みは41.5%、20〜199床の病院は73.5%、200〜399床は86.0%、400床以上は94.4%です。医療施設調査(令和5年)では一般病院が65.6%です。

電子カルテ普及率の数字はどこで公表されていますか

この記事の数字は、厚生労働省が2026年9月9日に公表した電子カルテ普及計画に載っているものです。2026年9月11日に、28ページと50ページの合計値の端数を一部修正しています。

出典

  1. 厚生労働省「電子カルテ普及計画」(2026年9月9日)
    https://www.mhlw.go.jp/content/10808000/001748251.pdf
  2. 厚生労働省「電子カルテ普及計画」公表ページ
    https://www.mhlw.go.jp/stf/newpage_76122.html
  3. 厚生労働省「医療情報化推進方針」(令和8年厚生労働省告示第370号)
    https://www.mhlw.go.jp/content/12600000/001756943.pdf

制度・料金・製品の情報は変わることがあります。記事は2026年10月11日時点の公開情報にもとづきます。手続きの前に、出典の原文と自治体・提供元の最新の案内をご確認ください。誤りに気づいた方はお問い合わせからお知らせください。

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